Medizin ist ohne eine umfassende und sorgfältig geplante Erhebung und Verarbeitung von Informationen nicht möglich. So beeinflusst in Krankenhäusern eine adäquate Informationslogistik wesentlich die Qualität der Patientenversorgung. Eine adäquate Präsentation und systematische Aufbereitung von Bild- und Biosignalbefunden kann diagnostische und therapeutische Entscheidungen unterstützen. Ebenso ist eine systematische Repräsentation von ärztlichem Wissen über die Diagnostik und Therapie von Erkrankungen und der Aufbau von Wissensbanken zur Entscheidungsunterstützung des Arztes hilfreich.

Der Fachbereich 'Medizinische Informatik' der Deutschen Gesellschaft für Medizinische Informatik, Biometrie und Epidemiologie (GMDS) und der Fachausschuss 'Medizinische Informatik' im Fachbereich ”Informatik in den Lebenswissenschaften” der Gesellschaft für Informatik (GI) sind in ihren Fachgesellschaften die Gliederungen, die sich mit der Informationsverarbeitung in der Medizin, d. h. mit Medizinischer Informatik, beschäftigen. Sie haben insbesondere das Ziel, den Nutzen und die Anwendbarkeit von Methoden und Werkzeugen der Medizinischen Informatik für die Medizin aufzuzeigen bzw. zu fördern sowie dem Praktiker Hilfen anzubieten. Alle Aktivitäten erfolgen in enger Zusammenarbeit und Abstimmung der beiden Fachgesellschaften. Die vertragliche Vereinbarung dieser Zusammenarbeitwurde im September 1999 gemäß der letzten Satzungsänderung der GMDS aktualisiert.

Innerhalb der GMDS finden Aktivitäten oft auch gemeinsam mit einer analogen Gliederung der jeweiligen medizinischen Fachgesellschaft statt, insbesondere die anwendungsorientierten Arbeiten in Arbeitskreisen, die auf bestimmte medizinische Teilgebiete bezogenen ist. Die Arbeits- und Projektgruppen des Fachbereichs "Medizinische Informatik" der GMDS wirken in der Regel fachgebietsübergreifend und sollen die Entwicklung, Evaluation und die adäquate Anwendung von Methoden und Werkzeugen der Medizinischen Informatik bzw. der Informatik in der Medizin und im Gesundheitswesen unterstützen.

Innerhalb der GI findet insbesondere ein Wissens- und Erfahrungsaustausch mit denjenigen Fachgruppen bzw. Fachbereichen statt, die sich mit methodischen Grundlagen der Informatik befassen. Damit soll eine adäquate methodische Weiterentwicklung der Medizinischen Informatik gefördert werden.