Arbeitsgruppe

Arbeitsgruppe
Statistische Methoden in der Bioinformatik -
gemeinsame Arbeitsgruppe der IBS-DR und der GMDS-Fachbereiche Med. Biometrie und Med. Bioinformatik/Systembiologie

Prof. Dr. Michael Altenbuchinger, Göttingen (Leiter) 
Prof. Dr. Tim Kacprowski, Braunschweig (Leiter)
Dr.-Ing. Markus Wolfien, Dresden (Leiter)

Tätigkeit vom 1. Januar 2023 bis 31. Dezember 2023

Die AG Statistische Methoden in der Bioinformatik und die AG Mathematische Modelle in der Medizin haben am 15. & 16. Juni 2023 ihren jährlichen, gemeinsamen „Workshop on Computational Models in Biology and Medicine“ abgehalten. Der Workshop hat an der Universität Stuttgart stattgefunden, wo er lokal von Prof. Nicole Radde ausgerichtet wurde. Es wurden Vorträge und Poster zu den folgenden Themenbereichen präsentiert:

• FAIR model and data principles
• Genomics and proteomics
• Single-cell data analysis
• Statistical modeling and machine learning
• Dynamical modeling in health and disease

Für Keynotes konnten folgende Redner gewonnen werden:

·        Lars Kaderali (University of Greifswald, Institute for Bioinformatics, Greifswald, Germany)

·        Matthias König (Humboldt-University Berlin, Institute for Theoretical Biology, Berlin, Germany)

·        Jana Wolf (Max-Delbrück-Center for Molecular Medicine (MDC), Berlin, Germany)

·        Achim Tresch (University of Cologne, Institute of Medical Statistics and Computational Biology, Cologne, Germany)

Der Workshop wurde von den jeweiligen Sprechern der AGs (Nicole Radde, Stuttgart; Ingmar Glauche, Desden; Michael Altenbuchinger, Göttingen; Tim Kacprowski, Braunschweig; Markus Wolfien, Dresden) organisiert. Die Veranstaltung wurde finanziell unterstützt durch die GMDS, die IBS-DR, sowie dem Exzellenzcluster EXC 2075 "Data-Integrated Simulation Science (SimTech)".

Des Weiteren wurde auf der GMDS Jahrestagung, neben dem AG Treffen, eine Session zu bioinformatischen Themen organisiert. Es konnte Prof. Dr. Richard Röttger (Department of Mathematics and Computer Science, University of Southern Denmark) für eine Keynote gewonnen werden. Weitere Vorträge befassten sich mit Workflows, GWAS und single-cell Sequenzierungsarbeiten.

Amtszeit der Leiter*innen und deren Vertretung 

Juni 2022 - Juni 2025 

Arbeitsgruppe
Statistische Methoden in der Bioinformatik -
gemeinsame Arbeitsgruppe der IBS-DR und der GMDS-Fachbereiche Med. Biometrie und Med. Bioinformatik/Systembiologie

Prof. Dr. Michael Altenbuchinger, Göttingen (Leiter) 
Prof. Dr. Tim Kacprowski, Braunschweig (Leiter)
Dr.-Ing. Markus Wolfien, Dresden (Leiter)

Tätigkeit vom 1. Januar 2022 bis 31. Dezember 2022
Die AG Statistische Methoden in der Bioinformatik und die AG Mathematische Modelle in der Medizin haben am 23. & 24. Juni 2022 ihren jährlichen, gemeinsamen „Workshop on Computational Models in Biology and Medicine“ abgehalten. Der Workshop hat an der Universität Göttingen stattgefunden, wo er lokal von Prof. T. Beißbarth und Prof. M. Altenbuchinger ausgerichtet wurde. Es wurden Vorträge und Poster zu den folgenden Themenbereichen präsentiert:

• Genomics and proteomics
• Single-cell data analysis and spatial transcriptomics
• Statistical modeling and machine learning
• Decision support systems
• Epidemiological models in the post COVID era
• Dynamical modeling
• Open Topics

Für Keynotes konnten folgende Redner gewonnen werden:

• Viola Priesemann (Max Planck Institute for Dynamics and Self-Organization, Neural systems theory, Göttingen, Germany)
  
  
• Stefan Bonn (Zentrum für Molekulare Neurobiologie (ZMNH), Institut für Medizinische Systembiologie, Hamburg)

• Harald Binder (Institute of Medical Biometry and Statistics, Faculty of Medicine and Medical Center – University of Freiburg, Freiburg, Germany)

Der Workshop wurde von den jeweiligen Sprechern der AGs (Michael Altenbuchinger, Göttingen; Klaus Jung, Hannover; Markus Scholz, Leipzig; Ingmar Glauche, Dresden) organisiert. Die Veranstaltung wurde finanziell unterstützt durch die GMDS sowie die IBS-DR.

Im Rahmen des Workshops wurden für die nächste Amtszeit Prof. Dr. Michael Altenbuchinger (Göttingen), Prof. Dr. Tim Kacprowski (Braunschweig), und Dr.-Ing. Markus Wolfien (Dresden) als Leiter der AG gewählt. 

Amtszeit der Leiter*innen und deren Vertretung 
24. Juni 2022 - 23. Juni 2025 

Tätigkeit vom 1. Januar 2021 bis 31. Dezember 2021
Die AG Statistische Methoden in der Bioinformatik und die AG Mathematische Modelle in der Medizin haben bedingt durch die COVID-19-Pandemie in 2021 ihren jährlichen „Workshop on Computational Models in Biology and Medicine“ ausgesetzt. 

Tätigkeit vom 1. Januar 2020 bis 31. Dezember 2020
Die AG Statistische Methoden in der Bioinformatik und die AG Mathematische Modelle in der Medizin haben am 4. & 5. Februar 2020 ihren jährlichen, gemeinsamen „Workshop on Computational Models in Biology and Medicine“ abgehalten. Der Workshop hat an der Universität Bonn stattgefunden, wo er lokal von Prof. Jan Hasenauer ausgerichtet wurde. Es wurden Vorträge und Poster zu den folgenden Themenbereichen präsentiert:
•           Genomik und Proteomik
•           Einzelzell-Datenanalyse
•           Statistische Modellierung und maschinelles Lernen
•           Dynamische Modellierung
Als Keynote Redner konnten Fabien Crauste (Université de Bordeaux), Volker Roth (Universität Basel), Dagmar Iber (ETH Zürich), und Malte Lücken (Helmholtz Zentrum, München) gewonnen werden.
Der Workshop wurde von den jeweiligen Sprechern der AGs (Michael Altenbuchinger, Stuttgart; Klaus Jung, Hannover; Markus Scholz, Leipzig; Ingmar Glauche, Dresden) organisiert. Die Veranstaltung wurde finanziell unterstützt durch die IBS-DR, die GMDS, sowie die Universität Bonn.

Tätigkeit vom 1. Januar 2019 bis 31. Dezember 2019

Das Ziel der AG „Statistische Methoden in der Bioinformatik“ ist es Wissenschaftler zu vernetzen, die sich mit der Anwendung und Entwicklung statistischer Methoden in der Bioinformatik beschäftigen. Hierfür werden jährliche Workshops angeboten. Im Jahre 2019 fand dieser zusammen mit der Arbeitsgruppe „Mathematische Modelle in der Medizin und Biologie“ am 7. und 8. März 2019 am Braunschweiger Zentrum für Systembiologie (BRICS) statt. Lokal wurde er von Michael Meyer-Herrmann und Philippe Robert ausgerichtet. Als Keynote Redner konnten Ivo Grosse (Universität Halle-Wittenberg), Jan Hasenauer (Helmholtz Zentrum München) und Benjamin Werner (The Institute of Cancer Research, London) gewonnen werden. Themenschwerpunkte waren Bioinformatik für NGS Daten, Machinelles Lernen und Optimierung in der Computational Biology und der Systembiologie, Multi-omics und die Modellierung von Erkrankungen.

Tätigkeit vom 1. Januar 2017 bis 31. Dezember 2017

Die AG Statistische Methoden in der Bioinformatik und die AG Mathematische Modelle in der Medizin haben am 2. & 3. März 2017 ihren jährlichen, gemeinsamen „Workshop on Computational Models in Biology and Medicine“ abgehalten. An der Veranstaltung, die dieses Jahr an der Tierärztlichen Hochschule Hannover stattfand, nahmen rund 50 Personen teil. Als Keynote-Sprecher waren Vanessa Didelez (Leibniz-Institut für Präventionsforschung und Epidemiologie, Bremen), Korbinian Strimmer (Imperial College, Bremen) und Arne Traulsen (Max-Planck-Institut für Evolutionäre Biologie) eingeladen. Vorträge und Poster wurden zu vielfältigen Themen der mathematischen Modellierung und der Statistischen Bioinformatik präsentiert. Der Workshop wurde von den jeweiligen Sprechern der AGs (Klaus Jung, Hannover; Holger Fröhlich, Bonn; Markus Scholz, Leipzig; Ingmar Glauche, Dresden) organisiert.