Ziele der Arbeitsgruppe
Ziel der Arbeitsgruppe ist, die verschiedenen Aktivitäten in Projekten sowie an Forschungsstandorten im Hinblick auf FAIRe Dateninfrastrukturen zu bündeln. Hierzu soll ein gemeinsamer Erfahrungsaustausch erfolgen, sowie gemeinsam an Konzepten (z.B. Verbreitung von FAIR, Koordinierung von Entwicklungen und Guidelines, etc.) im Bereich der Biomedizinischen Informatik und der zugrunde liegenden Daten zu arbeiten.
Folgende Aspekte sind Ausgangspunkte für zu bearbeitende Handlungsfelder dieser interdisziplinären Arbeitsgruppe:
- Gegenseitiger Erfahrungsaustausch und Austausch von Best Practices zu “FAIRen” Dateninfrastrukturen
- Austausch bezüglich Standardisierung von Daten, Metadaten und Datenmodellen national, EU-weit und international
- Sammeln und Bewerten der Passförmigkeit community-konsentierter Vokabularien zur Beschreibung von FAIRen Daten
- Diskussion spezieller Aspekte (z.B. Persistent Identifier) beim Aufbau und Betrieb von “FAIRen” Dateninfrastrukturen
- Beispiele zur Übertragbarkeit von Erfahrungen anderer Fach-Communities auf das Feld der Biomedizinischen Informatik.
- Erarbeitung eines gemeinsamen Verständnis von FAIR Data, Open Data und Open Access (6 Prinzipien), u.a. in Bezug auf unterschiedliche Datenarten sowie Datenschutzanforderungen und rechtliche Rahmenbedingungen
- Zielgruppenanalyse vornehmen und Anforderungen sammeln und kanalisieren
- Perspektivisch: Bündeln der Anforderungen aus dem FAIR data management an die Industrie (TMF, BVMI, NSG MI-I, VUD)
Geplante Aktivitäten
- Austausch über Anforderungen und existierende Lösungen für FAIRes Datenmanagement in den Life Sciences, sowie über existierende und geplante Projekte in regelmäßigen Gruppensitzungen (1-2x jährlich) und Web-Konferenzen
- Brückenbildung zwischen Anbietern von FAIR Datenmanagement Services und Plattformen und potentieller Anwender aus der Fachcommunity innerhalb der GMDS zum Austausch domänenspezifischer und allgemeiner User-Anforderungen
- Verankerung der FAIR Data Guiding Principles in der GMDS-Fachcommunity als potenziellen Userkreis
- Gemeinsame Workshops zu relevanten speziellen Themenkomplexen- Disseminierung
- Bessere Vernetzung der entsprechenden Datenmanagementsysteme und geplanter Projekte
- Register FAIRer biomedizinischer Datenrepositories (vgl. https://www.coretrustseal.org/)
- Gemeinsame Entwicklung von Ansätzen für die Interoperabilität (von Daten, Metadaten, Algorithmen, Modelle, Services)
- Diskussion und Austausch über Datenstandards und Standardisierungsvorhaben
- Gemeinsame Antragstellungen für Fördermittel
- Entwicklung von Guidelines zur Erstellung von FAIR Data Resources und Empfehlungen von Workflows/Tool chains zum Aufwerten von Daten
- Mittelfristig: Online-Tutorials
Kooperationen und Interaktionen
- Abstimmung mit anderen GMDS Arbeitsgruppen und Projektgruppen, z.B. der AG „Standards für Interoperabilität und elektronische Gesundheitsakten (SIE)“
- Begleitung der Entwicklungen in europäischen FAIR-Projekten: FAIRDOM, GO FAIR, FAIRplus, FAIR4Health oder FAIRsFAIR
- Beteiligung an der internationalen Research Data Alliance (RDA)
- Zusammenarbeit mit der European Open Science Cloud (EOSC)
- Sammlung von Anforderungen für eine Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) in Deutschland
- Begleitung der Entwicklungen in der deutschen Medizininformatik-Initiative
- Zusammenarbeit mit dem deutschen Netzwerk für Bioinformatik-Infrastruktur de.NBI und mit der europäischen Initiative EU-STANDS4PM (European standardization framework for data integration and data-driven in silico models for personalized medicine)
- Standardisierungsarbeit im Rahmen nationaler (DIN) und internationaler (ISO bzw. CEN/CENELEC) Normungsgremien, insbesondere im Rahmen von ISO/TC 215 „Health Informatics“, ISO/TC 276/WG5 „Data Processing and Integration“ und CEN/TC 251 „Health Informatics“
- Beteiligung an Community-Standardisierungsinitiativen, wie z.B. HL7 (Health Level 7), CDISC (Clinical Data Interchange Standards Consortium), COMBINE (Computational Modeling in Biology Network), GA4GH (Global Alliance for Genomics and Health) und an der europäischen COST-Action CHARME (Harmonising standardisation strategies to increase efficiency and competitiveness of European life-science research)
GMDS Jahresbericht 2023
Arbeitsgruppe
FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik
Martin Golebiewski, Heidelberg (Leiter)
Benjamin Löhnhardt, Göttingen (Stellvertreter)
Dr. Harald Kusch, Göttingen (Stellvertreter)
Matthias Löbe, Leipzig (Stellvertreter)
Tätigkeit vom 1. Januar 2023 bis 31. Dezember 2023
Die Arbeitsgruppe führte die Arbeiten der letzten Jahre fort, wobei es insbesondere mit der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur für personenbezogene Gesundheitsdaten (NFDI4Health) zu einer verstärkten Zusammenarbeit kam.
Durchgeführte Veranstaltungen:
- Workshop FAIRe klinischer Daten durch Transformation in HL7 FHIR mit Mirth Connect zur GMDS DMEA-Satellitenveranstaltung vom 24.04.2023
- Tutorial T10 – FAIR data management tools in biomedical research, GMDS-Jahrestagung 2023 in Heilbronn
Amtszeit der Leiter und deren Vertretung
Monat Jahr bis Monat Jahr
Archiv der Tätigkeitsberichte
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AKTIVITÄTEN IM JAHR 2022
AKTIVITÄTEN IM JAHR 2022
Arbeitsgruppe
FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik
Martin Golebiewski, Heidelberg (Leiter)
Benjamin Löhnhardt, Göttingen (Stellvertreter)
Dr. Harald Kusch, Göttingen (Stellvertreter)
Matthias Löbe, Leipzig (Stellvertreter)
Tätigkeit vom 1. Januar 2022 bis 31. Dezember 2022
Die Projektgruppe führte die Arbeiten der letzten Jahre fort, wobei es insbesondere mit der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur für personenbezogene Gesundheitsdaten (NFDI4Health) zu einer verstärkten Zusammenarbeit kam.
Workshop "Wie mache ich Health-Daten FAIR: Benutzung der Forschungsdateninfrastrukturen von NFDI4Health und FAIR4Health"
Am 25. April 2022 führte die Projektgruppe im Rahmen der Satellitenveranstaltung von GMDS und BVMI vor der DMEA in Berlin einen ganztägigen Workshop durch. Ziel war es, Infrastrukturen, Werkzeuge und Dienste von zwei Initiativen vorzustellen, die Daten des Gesundheitswesens FAIR im Sinne der FAIR Guiding Principles machen und Nutzeranforderungen aus dem kreis der Teilnehmenden zu diskutieren.
Im ersten Teil: NFDI4Health (Programm liegt mir nicht mehr vor @Martin)
Der zweite Teil des Workshops begann mit Grußworten der Vorsitzenden der neu gegründeten Arbeitsgruppe FAIR data in Health Research Performing Organizations der European Federation for Medical Informatics (EFMI), Alicia Martinez-Garcia aus Sevilla. Nach einer Vorstellung der Architektur des EU-Projekts FAIR4Health stellte Christian Draeger, Leipzig, das FAIR4Health Data Curation Tool zum Transformieren von Daten aus Dateien und Datenbanken nach HL7 FHIR vor. Anschließend wurde die Pseudonymisierung und Anonymisierung von FHIR-Daten mit Hilfe des FAIR4Health Data Privacy Tools gezeigt. Wie Werkzeuge sowie Beispieldaten befinden sich in einem GitHub-Repository der Projektgruppe. Mona Perbix, Leipzig, demonstrierte die Möglichkeit retrospektiver Analysen auf verteilten, vertrauchlichkeitserhaltenden Knoten der FAIR4Health Data Platform. Matthias Löbe, Leipzig, erläuterte den Upload von Ergebnisdatensätzen in ein Forschungsdatenmanagementsystem. Zuletzt wurde der aktuelle Entwurf des FHIR Implementation Guides der Aktivität FHIR4FAIR von HL7 Europe vorgestellt.
Workshop zur GMDS 2022 in Kiel
Die Arbeitsgruppe hatte einen Workshop zur GMDS 2022 in Kiel avisiert. Mit der Absage der Veranstaltung vor Ort wurde versucht, alternativ ein Onlineformat zu realisieren, was aber wegen Terminkollissionen der Referenten nicht erfolgreich war.
Amtszeit der Leiter und deren Vertretung
Monat Jahr bis Monat Jahr -
AKTIVITÄTEN IM JAHR 2021
AKTIVITÄTEN IM JAHR 2021
GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“
Präambel
Die GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“ wurde am 28. Februar 2019 gegründet. In ihr werden verschiedene Aktivitäten zum Datenmanagement und zur Datenstandardisierung in der Biomedizin für den Aufbau von FAIRen („findable“, „accessible“, „interoperable“, „reusable“) Dateninfrastrukturen gebündelt. Längerfristiges Zielsetzung dabei ist die Verankerung der FAIR Data Guiding Principles in der GMDS-Fachcommunity. Regelmäßig erfolgt dazu ein gemeinsamer Erfahrungsaustausch der Beteiligten mit dem Ziel, gemeinsam an Konzepten und Lösungen für informatische Problemstellungen rund um die zugrundeliegenden Datenarten zu arbeiten (z.B. zur Verbreitung der FAIR-Prinzipien, zur Koordinierung von einschlägigen Werkzeug-Entwicklungen oder zur Entwicklung von Guidelines). Dabei sollen insbesondere die existierenden nationalen und internationalen Netzwerke eingebunden werden:
Beteiligung einschlägigen Gruppen der Research Data Alliance (RDA) in Deutschland
und internationalZusammenarbeit mit der European Open Science Cloud (EOSC), insbesondere EOSC-Life
Sammlung von Anforderungen für eine Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI)
in Deutschland zur Bündelung von Daten und Studien aus den LebenswissenschaftenBegleitung der Entwicklungen in der deutschen Medizininformatik-Initiative
Aktivitäten in 2021
Wie viele andere Gebiete auch litt die Arbeit der Projektgruppe im Jahr 2021 stark unter den Einschränkungen der Covid-19-Epidemie. So konnten eine ganze Reihe geplanter Tätigkeiten nicht oder nur in geringem Umfang durchgeführt werden. Dies betraf insbesondere Arbeitstreffen, die in den Vorjahren besucht und durch eigene Aktivitäten unterstützt wurden, bspw. die Jahrestagung der Research Data Alliance (RDA) Deutschland, die GMDS-Jahrestagung, die Medical Informatics Europe Conference oder die MEDINFO 2021. Hier konnten bereits positiv begutachtete Workshopeinreichungen nicht durchgeführt werden.
Im Rahmen der Taskforce Covid-19 der Nationale Forschungsdateninfrastruktur für personenbezogene Gesundheitsdaten (NFDI4Health) wurde ein Metadatenschema entwickelt und implementiert, welches Studienvorhaben im Bereich der klinischen und epidemiologischen sowie der Public-Health-Forschung mit einem breiten Satz an Parametern erfasst (Studienmetadaten, Dokumente, semantische Strukturen, Datensätze). Damit wird die FAIRness von COVID-19-Forschungsdatensammlungen verbessert. Aktuell werden die Arbeiten in NFDI4Health mit breiterem Scope fortgeführt [German Central Health Study Hub].
Im EU-Horizon2020-Projekt “Improving Health Research in EU through FAIR Data” (FAIR4Health) wurde ein Common Data Model auf Basis von HL7 FHIR konzipiert sowie eine Werkzeugpalette zum Laden, Transformieren und Anonymisieren von Patientendaten entwickelt. Des Weiteren wurde eine Plattform zum verteilten Rechnen implementiert und an zwei klinischen Anwendungsfällen evaluiert. Die Ergebnisse wurden während der EFMI – Special Topic Conference (STC) 2021 „Applying the FAIR principles to accelerate health research in Europe in the post-Covid19 era” präsentiert. Resultierend daraus entstanden neue Initiativen wie die EFMI Working Group FAIR data in Health Research Performing Organizations, das HL7 International Projekt FHIR for FAIR (FHIR4FAIR) und die RDA Raising FAIRness in health data and health research performing organisations.
Daneben wurden die Ziele und Arbeiten der Projektgruppe in einer Reihe nationaler Veranstaltungen vorgestellt.
Nächste Aktivitäten
Die Projektgruppe plant Workshops im Rahmen der DMEA - Satellitenveranstaltung 2022 von GMDS und BVMI sowie der 67. GMDS-Jahrestagung 2022.
Über die TMF – Technologie- und Methodenplattform für die vernetzte medizinische Forschung e.V. soll die FAIRness der Portals Toolpool Gesundheitsforschung speziell im Hinblick auf FAIR Research Software untersucht und verbessert werden.
Weitere Beiträge werden aus internationalen Initiativen zur Verwaltung von Forschungsdaten (RDA, EOSC-Life, GO FAIR), Standardisierungsorganisationen (CDISC, ISO) und laufenden europäischen (FAIR+, FAIRsFAIR) und nationalen Projekte (GHGA, NFDI4Health) erfolgen.
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AKTIVITÄTEN IM JAHR 2020
AKTIVITÄTEN IM JAHR 2020
GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“
Präambel
Die GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“ wurde am 28. Februar 2019 gegründet. In ihr werden verschiedene Aktivitäten zum Datenmanagement und zur Datenstandardisierung in der Biomedizin für den Aufbau von FAIRen („findable“, „accessible“, „interoperable“, „reusable“) Dateninfrastrukturen gebündelt. Längerfristiges Zielsetzung dabei ist die Verankerung der FAIR Data Guiding Principles in der GMDS-Fachcommunity und . Regelmäßig erfolgt dazu ein gemeinsamer Erfahrungsaustausch der Beteiligten mit dem Ziel, gemeinsam an Konzepten und Lösungen für informatische Problemstellungen rund um die zugrundeliegenden Datenarten zu arbeiten (z.B. zur Verbreitung der FAIR-Prinzipien, zur Koordinierung von einschlägigen Werkzeug-Entwicklungen oder zur Entwicklung von Guidelines). Dabei sollen insbesondere die existierenden nationalen und internationalen Netzwerke eingebunden werden:
Beteiligung einschlägigen Gruppen der Research Data Alliance (RDA) in Deutschland und international
Zusammenarbeit mit der European Open Science Cloud (EOSC), insbesondere EOSC-Life
Sammlung von Anforderungen für eine Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) in Deutschland zur Bündelung von Daten und Studien aus den Lebenswissenschaften
Begleitung der Entwicklungen in der deutschen Medizininformatik-Initiative
Aktivitäten in 2020
Die Arbeit der Projektgruppe wurde von deren Leiter Martin Golebiewski bei der Jahrestagung 2020 der Research Data Alliance (RDA) Deutschland in Potsdam (25.-27.02.2020) vorgestellt. In seinem Vortrag “FAIR Data Infrastructures for Biomedical Research” erläuterte er den ca. 200 Teilnehmenden der Konferenz vor Ort die Aktivitäten der Gruppe und damit in Verbindung stehender anderer Initiativen, wie beispielsweise FAIRDOM, FAIR4Health und EU-STANDS4PM (European standardisation framework to facilitate in silico driven personalised medicine). Mit diesen Initiativen besteht bereits ein Kontakt mit Informationsaustausch, sowie personellen Überschneidungen, und eine weitergehende Zusammenarbeit mit der Projektgruppe ist bereits geplant. Die Bedeutung von Daten- und Metadatenstandards und deren Definition insbesondere durch internationale Gremien wie dem Normungsausschuss für Biotechnologie (ISO/TC 276) der Internationalen Organisation für Normung (ISO) wurde im Vortrag betont. Auch die besondere und zentrale Bedeutung der Projektgruppe für die Analyse der Anforderungen aus der GMDS-Community an die neu etablierte Nationale Forschungsdateninfrastruktur für personenbezogene Gesundheitsdaten (NFDI4Health) für die Bereitstellung entsprechender Dienste und Plattformen für “Health”-Daten wurde bei dieser Gelegenheit diskutiert.
Alle Mitglieder der Leitungsebene, sowie etliche Mitglieder der der Projektgruppe sind als Partner bei NFDI4Health beteiligt. Das Konsortium aus ca. 20 Partnern hat seine Arbeit im Oktober 2020 aufgenommen und wird längerfristig gefördert durch Bund und Länder. Das Ziel von NFDI4Health ist die Verschmelzung von epidemiologischer, Public Health- und klinischer Forschung. Ein multidisziplinäres Team aus Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftlern soll dazu eine Forschungsdateninfrastruktur in Deutschland aufbauen für personenbezogene Gesundheitsdaten. Forschungsdaten aus ganz Deutschland sollen dadurch nach den FAIR-Prinzipien international zugänglich gemacht werden, inklusive der Daten aus großen epidemiologischen Studien und der Public-Health-Forschung, sowie klinischen Studien. Dabei sollen Datenbanken aus Wissenschaft und Forschung systematisch erschlossen, nachhaltig gesichert, zugänglich gemacht und schließlich auch national und international vernetzt werden. Insgesamt 48 Institutionen aus dem Gesundheitsbereich haben ihre Beteiligung zugesichert, darunter auch weitere Fachgesellschaften und wichtige epidemiologische Kohorten, außerdem gibt es Unterstützung von 37 internationalen Institutionen. Die Koordination des Bereichs “Standards for FAIR Data” (TA2) von NFDI4Health übenimmt der Leiter der GMDS-Projektgruppe und weitere Partner von NFDI4Health sind ebenfalls aktiv in der Gruppe, wodurch ein intensiver Informationsaustausch gewährleistet ist. Die GMDS-Projektgruppe ist dabei vorgesehen zur Verankerung der nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) in der GMDS-Gemeinschaft, zur Sammlung des entsprechenden Bedarfs aus der Community und Bündelung der Kommunikation über entsprechend entwickelte Dienste von NFDI4Health.
Ein von der DFG gefördertes Projekt, die COVID-19 Taskforce von NFDI4Health, hat dabei bereits im Sommer 2020 die Arbeit aufgenommen, mit dem Ziel, harmonisierte, kooperative medizinische, epidemiologische und Public Health-Forschung zu stärken und eine substanzielle und rasche Information der Fachcommunity über relevante Studien und deren Ergebnisse zu COVID-19 zu ermöglichen. Dabei wird, auch unter Beteiligung der GMDS-Projektgruppe, unter anderem ein Studienportal (“StudyHub”) für epidemiologische, klinische und Public-Health-Studien zu Covid-19 in Deutschland aufgebaut. Weitere Ziele sind die Verbesserung der FAIRness von COVID-19-Forschungsdatensammlungen, die Förderung der zeitnahen Durchführung von harmonisierten Forschungsarbeiten im Zusammenhang mit COVID-19, und ein angestrebtes Record Linkage verschiedener COVID-19-Datensätze zu ein und derselben Person.
Als zentrale Veranstaltung in 2020 der GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“ fand im Rahmen der virtuellen GMDS-Jahrestagung am 15.10.2020 ein von der Projektgruppe organisierter Workshop „FAIR data infrastructures for biomedical research communities“ statt, welcher gleichzeitig das jähriliche Projektgruppenmeeting war. Ziel war eine Brückenbildung zwischen Anbietern und Entwicklern von FAIR Datenmanagement Services und Plattformen im Bereich der biomedizinischen Forschung einerseits und potentiellen Anwender aus der Fachcommunity andererseits zum Austausch von User-Anforderungen und zur Diskussion und den Informationsaustausch über Datenstandards und Standardisierungsvorhaben. In den teilweise internationalen Vorträgen wurden Aktivitäten und Tools rund um FAIRe Dateninfrastrukturen vorgestellt und in einem breiten Publikum diskutiert. Darunter waren Beiträge aus Organisationen und Initiativen, welche sich der Standardisierung von Daten aus dem biomedizinischen Bereich widmen, wie die Research Data Alliance (RDA), dem Clinical Data Interchange Standards Consortium (CDISC), HL7 oder GO FAIR. Neben den Keynotes von Prof. Carole Goble (University of Manchester) über “Faring with FAIR” sowie Prof. Nilas Blomberg (Director of ELIXIR and coordinator of EOSC-Life), gab es auch Präsentationen von europäischen Projekten, wie FAIRSharing, FAIR4Health, FAIRness for FHIR und ECRIN (European Clinical Research Infrastructure Network), sowie von Initiativen im Bereich der NFDI.
Darüber hinaus wurde die Sammlung von Informationen über einschlägige Konsortien und Initiativen, sowohl national als international, zum Aufbau eines Registers biomedizinischer Communites für FAIRe Datenifrastrukturen im Biomedizinischen Bereich fortgeführt.
Nächste Aktivitäten
Die Projektgruppe plant einen Online-Workshop im Rahmen der 66. GMDS- & 12. TMF-Jahrestagung 2021. Weitere Beiträge werden aus internationale Initiativen der Verwaltung von Forschungsdaten (RDA, EOSC-Life, GO FAIR), Standardisierungsorganisationen (CDISC, ISO) und laufenden europäischen (FAIR4Health, FAIR+, FAIRsFAIR) und nationalen Projekte (GHGA, NFDI4Health) erfolgen.
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AKTIVITÄTEN IM JAHR 2019
AKTIVITÄTEN IM JAHR 2019
GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“
Präambel
Die GMDS-Projektgruppe „FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik“ wurde am 28. Februar 2019 gegründet. In ihr werden verschiedene Aktivitäten zum Datenmanagement und zur Datenstandardisierung in der Biomedizin für den Aufbau von FAIRen („findable“, „accessible“, „interoperable“, „reusable“) Dateninfrastrukturen gebündelt. Längerfristiges Zielsetzung dabei ist die Verankerung der FAIR Data Guiding Principles in der GMDS-Fachcommunity und . Regelmäßig erfolgt dazu ein gemeinsamer Erfahrungsaustausch der Beteiligten mit dem Ziel, gemeinsam an Konzepten und Lösungen für informatische Problemstellungen rund um die zugrundeliegenden Datenarten zu arbeiten (z.B. zur Verbreitung der FAIR-Prinzipien, zur Koordinierung von einschlägigen Werkzeug-Entwicklungen oder zur Entwicklung von Guidelines). Dabei sollen insbesondere die existierenden nationalen und internationalen Netzwerke eingebunden werden:
● Beteiligung an den Gruppen der Research Data Alliance (RDA)
● Zusammenarbeit mit der European Open Science Cloud (EOSC), insbesondere EOSC-Life
● Sammlung von Anforderungen für eine Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) in Deutschland
● Begleitung der Entwicklungen in der deutschen Medizininformatik-InitiativeAktivitäten in 2019
Während der GMDS-Jahrestagung in Dortmund fand am 10.09.2019 ein von der Projektgruppe organisierter Workshop „FAIR data infrastructures for biomedical research communities“ als Projektgruppentreffen statt. Ziel war eine Brückenbildung zwischen Anbietern und Entwicklern von FAIR Datenmanagement Services und Plattformen im Bereich der biomedizinischen Forschung einerseits und potentiellen Anwender aus der Fachcommunity andererseits zum Austausch von User-Anforderungen und zur Diskussion und den Informationsaustausch über Datenstandards und Standardisierungsvorhaben. In den teilweise internationalen Vorträgen wurden Aktivitäten und Tools rund um FAIRe Dateninfrastrukturen vorgestellt und in einem breiten Publikum diskutiert. Darunter waren Beiträge aus Organisationen und Initiativen, welche sich der Standardisierung von Daten aus dem biomedizinischen Bereich widmen, wie die Research Data Alliance (RDA), dem Clinical Data Interchange Standards Consortium (CDISC), HL7 oder GO FAIR. Neben einer Keynote von Wolfgang Müller (Heidelberg) über “FAIR Data”, gab es auch Präsentationen von europäischen Projekten, wie FAIRDOM, FAIR4Health, EU-STANDS4PM (European standardization framework for data integration and data-driven in silico models for personalised medicine) oder Personal Health Train, und von zukünftigen Initiativen im Bereich der NFDI (NFDI4Health und NFDI4Med). Ein besonderer Schwerpunkt waren ferner Infrastruktur-Implementierungen auf Basis der Software SEEK (FAIRDOM, Leipzig Health Atlas).
Darüber hinaus wurde die Sammlung von Informationen über einschlägige Konsortien und Initiativen, sowohl national als international, zum Aufbau eines Registers biomedizinischer Communites für FAIRe Datenifrastrukturen im Biomedizinischen Bereich begonnen.Nächste Aktivitäten
Trotz der aktuell unsicheren Situation planen wir für einen Workshop im Rahmen der GMDS-Jahrestagung in Berlin am 8. September 2020. Als Keynote-Speaker hat Prof. Carole Goble von University of Manchester (UK) zum Thema “Let’s go on a FAIR asset management safari” zugesagt. Weitere Beiträge werden aus internationale Initiativen der Verwaltung von Forschungsdaten (RDA, EOSC-Life, GO FAIR), Standardisierungsorganisationen (CDISC, ISO) und laufenden europäischen (FAIR4Health, FAIR+, FAIRsFAIR) und nationalen Projekte (GHGA, NFDI4Health) erfolgen.