Die folgenden vier Fachausschüsse der GMDS sind für die Aktivitäten in ihrem jeweiligen Fachbereich verantwortlich. Zu ihren Aufgaben gehören neben der Leitung des Fachbereiches insbesondere die Fortbildung, die Betreuung der Projekt- und Arbeitsgruppen sowie der Arbeitskreise, die internationalen Beziehungen und die Organisation von Tagungen.
Medizinische Informatik
Biometrie
Epidemiologie
Medizinische Bioinformatik
und Systembiologie