Jahresberichte

Projektgruppe
Entwicklung, Implementierung und Dokumentation von Data Processing Workflows

Markus Wolfien, Dresden (Leiter) 

Tätigkeit vom 1. Januar 2023 bis 31. Dezember 2023

Die Erstellung von Workflows bildet einen zentralen Punkt innerhalb der Datenanalyse und der Datenintegration, da der Vergleich und die Auswahl geeigneter Analysewerkzeuge für ein bestimmtes Problem sehr komplexe Herangehensweisen erfordert. Deshalb beschäftigt sich die Projektgruppe (PG) mit der Sichtung, Erstellung und Implementierung von Workflows sowie deren zugrundeliegenden Rahmenbedingungen. Die PG besteht aus elf aktiven und passiven Mitgliedern, die überwiegend im akademischen Bereich innerhalb und außerhalb der GMDS beschäftigt sind. Die Tätigkeiten umfassen die Organisation von Workshops, das Verfassen von Publikationen sowie ein themenbezogener Informationsaustausch über Datenanalyseabläufe und ein jährliches Treffen auf der GMDS Jahrestagung.

Im Jahr 2023 umfassten die Aktivitäten der Projektgruppe mehrere Veranstaltungen im Rahmen der GMDS Jahrestagung in Heilbronn. Zwei Workshops wurden zu den Themen „Best Practices im Machine Learning und OMOP" sowie zur „Integration von Genexpressionsdaten in Disease Maps“ durchgeführt. Zusätzlich fand ein BarCamp zur Integration von Single-Cell-Daten in Disease Maps und klinischen Anwendungen statt. Ziel des BarCamps war es thematisch mit interdisziplinären Experten zu diskutieren, sowie zusätzlich einen vorab erstellten Fragebogen auszufüllen. Die Ergebnisse mit insgesamt über 50 Antworten wurden gesammelt und derzeit in einen wissenschaftlichen Artikel überführt.

Amtszeit der Leiter*innen und deren Vertretung

Oktober 2021 bis Oktober 2024