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Arbeitsgruppe

FAIRe Dateninfrastrukturen für die Biomedizinische Informatik

GMDS DMEA-Satellitenveranstaltung vom 24.04.2023

FAIRe klinischer Daten durch Transformation in HL7 FHIR mit Mirth Connect

Moderation

Matthias Löbe (Leipzig), Samer Alkarkoukly (Köln)

HL7 FHIR gewinnt in der Krankenversorgung aufgrund vielfältiger regulativer und wissenschaftsgetriebener Initiativen stark an Bedeutung (MIOs, ISiK, MII, NUM, NFDI4Health). Gleichwohl fehlt es an kostengünstigen, breit einsetzbaren und performanten Lösungen zur Transformation von Bestanddaten nach FHIR. Der Workshop stellt eine quelloffene, nutzerfreundliche Lösung vor, um Daten aus einfachen Formaten wie CSV nach FHIR zu konvertieren. Der Ansatz basiert auf der Verwendung des freien Kommunikationsservers Mirth Connect. Nach einer Einführung und Vorstellung werden die Teilnehmer ein Beispielszenario praktisch umsetzen und die Ergebnisse auf einen FHIR-Server hochladen. Im Ergebnisteil wird die Lösung diskutiert und Kriterien abgeleitet, wie die FAIR Data Prinzipien durch die Verwendung von FHIR-Artefakten optimal umgesetzt werden.

Voraussetzungen

Zeitplan

11.00 Uhr     Begrüßung und Einführung

Themenblock A: Grundlagen und Informationsarchitektur (Englische Sprache)
Moderation:  Samer Alkarkoukly
11.15 Uhr      Introduction to Data Transformation with Mirth Connect
11.35 Uhr      Demo on CSV-FHIR Transformation
12.15 Uhr      Q&A
12.30 Uhr     Imbiss

Themenblock B: Praktische Umsetzung und Demonstration (Englische Sprache)
Moderation:  Samer Alkarkoukly
13.30 Uhr       Exercises Overview
13.45 Uhr       Scenario 1: CSV to FHIR (local and server)
14.05 Uhr       Scenario 2: FHIR - CSV
15.00 Uhr      Kaffeepause

Themenblock C: Ergebnisdiskussion und Ausblick
Moderation:  Matthias Löbe
15.30 Uhr       Vorstellung der Referenzlösung
16.15 Uhr      Abschlussdiskussion: FAIRe Daten durch Verwendung von FHIR – Anforderungen an FHIR-Strukturen aus Sicht des RDA FAIR Reifegradmodells

17.00 Uhr        Ende des Workshops